A base do ensino médico é voltada para os avanços das novas e diversificadas tecnologias de diagnóstico e tratamento de enfermidades. Doenças que há pouco tempo eram fatais hoje são consideradas doenças crônicas, aumentando a expectativa de vida dos pacientes. Além dos avanços científicos, os cursos do País dão cada vez mais atenção à formação humanizada desse profissional, que lida diretamente com as pessoas e suas famílias em momentos de grande fragilidade física e emocional.
A atribuição do médico é atender a maioria da população de uma comunidade, independentemente de sexo e idade, com ênfase nos problemas de saúde mais comuns naquele grupo. Para isso, precisa ter conhecimentos sólidos de como promover a prevenção de doenças e a reabilitação do organismo. Ele pode atuar em instituições públicas do Sistema Único de Saúde (SUS), em consultórios particulares, em convênios e cooperativas médicas ou optar por formar novos médicos, dedicando-se ao ensino e à pesquisa.
A Faculdade de Medicina da Unesp, no Câmpus de Botucatu, segue a tendência das melhores escolas do mundo nessa área ao envolver os alunos em atividades de pesquisa e de atendimento à comunidade. Essa interação ini­cia-se logo nos primeiros anos do curso, quando são ministradas as disciplinas básicas da área, como Anatomia e Fisiologia Humana.
Os dois últimos anos de gra­duação são em regime de internato em diversas instituições da região, como a Maternidade do Hospital Regional Sorocabano, o Centro de Saúde Escola de Botucatu, as Unidades Básicas de Saúde de Botucatu, além do Hospital de Clínicas da Unesp e do Hospital Estadual de Bauru, administrado pela Universidade. Como o trabalho no pronto-socorro e no atendimento de urgências e emergências costuma marcar os primeiros anos da carreira, atividades nessas áreas têm sido valorizadas nas disciplinas desse momento do curso.

A Faculdade também oferece programas de residência médica, com duração de 3 a 5 anos, de acordo com a área escolhida. Todos os anos, um concurso público é aberto a médicos de todo País para ingresso nesses programas.
Para quem deseja prosseguir os estudos, a unidade oferece nove programas de pós-graduação stricto sensu, com mestrado e doutorado, que podem ser cursados ainda durante o período da residência médica.
O curso da Unesp é um dos mais concorridos do País. Para estimular os estudantes de escolas públicas a disputarem as vagas, a unidade mantém um cursinho pré-vestibular para alunos de baixa renda.
Também são realizados diferentes projetos de apoio à comunidade, como um programa de alfabetização de jovens e adultos por meio da educação em saúde. Outras ações de divulgação de temas científicos e de prevenção de epidemias são praticadas pelos alunos, sob coordenação dos professores. Entre os exemplos, destacam-se as campanhas de doação de sangue e de exames de vista.
Outro ponto forte do curso é a infraestrutura, que no início de 2011 foi ampliada com a inauguração de um complexo com quase 6 mil m² de área coberta, reunindo uma central de salas de aula, setor administrativo e Centro de Memória e Arquivo.